static class Swapper{
void method(String[] s)
     {  }
  }

与
 class Swapper{
     static void method(String[] s)
     {  }
  }

是不是一样的意思?

当然不一样！！
static class Swapper{
void method(String[] s)
     {  }
  }
这种用法只可能是内部类才能用static，但是这样似乎和不用static没有什么两样
class Swapper{
     static void method(String[] s)
     {  }
  }
是这个类的某个方法是static，那么调用这个方法时就可以直接Swapper.method(String[] s)，不用实例化class。
和前面的想比，差别在于前面的要实例化class，而且前面的class只能是内部类！！（因为有个static修饰）

不是。

第一个是一个静态的内部类，作为外部类的一个类属性来看
要访问其中的方法，必须
public class InnerClass1
{
  static class A
  {
    void methodA()
    {
      System.out.println("sdfsdf");
    }
  }
  
  public static void main(String[] args)
  {
    new InnerClass1().new A().methodA();
  }
}

第二个是一个普通类（不可能是内部类，内部成员类不能有static声明），里面有一个静态方法

首先,静态类只能是内部类;也就是说它属于一个类.
静态的方法也一样,它属于一个类,而不是一个实例.静态的东西只有一个.

补充一点，
static class Swapper{
void method(String[] s)
     {  }
  }
这么定义这个内部类的化，不妨定义其为class alpha下的
public class alpha() {
  static class Swapper{
    void method(String[] s) {
    }
  }
}
那么在另一个class里面调用这个类，可以不实例化alpha直接实例化Swapper，就像调用一个static方法一样。比如我要在其它class里面调用Swapper的方法method，可以如下不用实例化alpha
alpha.Swapper swapper = new alpha.Swapper();
swapper.method(String[] s);