假设我扫描的目录为 $DATAPATH，这个目录下会有个文件file1,每当我readdir得到的结果为file1时我就处理该文件。
但是，file1是别的程序从其他的地方拷贝过来，文件很大，readdir得到的文件会不完整，
如何避免这个问题？

我又没让你去比较checksum
只是对一个存在的文件进行cksum操作
如果文件还未完全拷贝完/或者说资源正忙碌,其是无法得到checksum的

你的问题实际上就是想知道其他程序何时完成文件copy

当你readdir到文件file1时，可以对其进行改名操作/rm，或者计算checksum/cksum等操作
如果成功则说明文件已经完成，之后就可以对其进行操作了

简单的说，只有复制这个文件的进程知道复制是否成功，所以所有的手脚都应该由复制这个文件的进程去做：

1、使用临时文件名，当复制完成，经过校验之后，再改名为目标文件名（如用 ~copy_file_XXX.tmp 等名字）
2、复制文件之前先复制一个同名.MD5SUM 的文件，写上源文件的 MD5 checksum 值；这样利用文件的进程可以自己做检查。
3、等等，扩展性思维吧。

如果确保复制文件的进程不会中途失败，可以 lsof /file 检查是否有进程正在写入这个文件。