int rect[13][4];           // 此数组存放12个颜色框的坐标
  rect[0]={50,100,150,200};
  rect[1]={150,100,250,200};
  ......
在applet中，我这样写，不可以吗？必需一个一个地附值吗？

不管你要做什么,先说两个错误:
1.类应申明为public
2.数组srect没初始化,
在init中加入srect = new int[13][4];

方法1:
    int[][] a = {
        {50,100,150,200},
        {150,100,250,200}
        ...
        };
方法2:
        int[][] a;
        a= new int[][]{
        {50,100,150,200},
        {150,100,250,200}
        ...
        };

int[][] rect是申明一个变量，类型是整型数组的数组，
java中变量相当于C++指针，并不直接分配内存，变量的类型也只有八种数据原型及类和数组而已，而不存在特定的int[13][4]数组。

你以为这是c++啊。