下面是我执行make时的一段日志，
( cd ../external/RSL/RSL ; 
make CC=mpicc FC=mpif77  MAX_DOMAINS=1 MAX_PROC=1024 LEARN_BCAST=-DLEARN_BCAST linux )

make -r -f makefile.linux LINUX_MPIHOME= SED_LINE="-e s/IMAX_MAKE// -e s/JMAX_MAKE// -e s/MAXDOM_MAKE/1/ -e s/MAXPROC_MAKE/1024/" CONFIG_OPTS="-DIMAX_MAKE= -DJMAX_MAKE= -DMAXDOM_MAKE=1 -DMAXPROC_MAKE=1024 -DHOST_NODE=0 -DMON_LOW=1 -DALLOW_RSL_168PT=1 -DLEARN_BCAST" all
cat rsl.h  rsl_comm.h compat.h | sed -e s/IMAX_MAKE// -e s/JMAX_MAKE// -e s/MAXDOM_MAKE/1/ -e s/MAXPROC_MAKE/1024/ |
grep '^#.*define.*/* FORTRAN */' | 
awk '{printf("      integer %sn      parameter(%s=%s)n",$2,$2,$3)}' | 
cat rsl.inc_base - > rsl.inc

mpicc -c -I/include -DMPI -DRSL_SYNCIO -Dlinux -DSWAPBYTES -O -DIMAX_MAKE= -DJMAX_MAKE= -DMAXDOM_MAKE=1 -DMAXPROC_MAKE=1024 -DHOST_NODE=0 -DMON_LOW=1 -DALLOW_RSL_168PT=1 -DLEARN_BCAST set_padarea.c

怕是不行，你需要有sed ，sed 在windows 怕是没有了
你试试把make 以后生成的文件copy到windows 下

.........
vs2005的编译器的参数一览你准备好了么？
cpp的参数一览你准备好了么？


至于说
-DRWORDSIZE=4
==>
#define  RWORDSIZE  4

你可以专门做一个头文件，里面就写上这些整理过的定义
也可以直接在vs2005里面使用这些宏定义。vs2005里面怎么写这些宏你参考一下vs的帮助文档。

sed /!.*'/s/'//g
应该分两部分来看：
/!.*'/  是指对 含有 !且后边跟有'的情况的行处理


s/'//g 就是对全部的行中的'替换完毕

比如
sed /!.*'/s/'//g

对 
111
222
333'
!'
!4'
!4444444'''''
中的最后三行，将所有的' 替换完

下边的命令：


/usr/bin/cpp -I../inc -I. -C -P -DRSL -DDM_PARALLEL -DNOUNDERSCORE -DIWORDSIZE=4 -DRWORDSIZE=4 -DLWORDSIZE=4 -DDWORDSIZE=8 -I../external/RSL/RSL -C -P `cat ../inc/dm_comm_cpp_flags` -DNO_RRTM_PHYSICS  module_state_description.b  > module_state_description.f

这一行，应该是定义数据类型长度的

建议：在linux 下make ，然后，对生成的参数进行修改：
如果是涉及可移植的，就查看宏定义是什么意思
如果是涉及数字类型的，就看windows 下这个值是多大，写进去就行了


偶也木有做过这活，不能说更多了

还有，从楼主提的这些问题来看，操作过程中怕是还会遇到很多问题。
尽量提完整问题吧，这里不是简单的把makefile翻译过来就能解决问题的。

有啥问题？  这个句子在动态的根据C的定义生成fortran语句声明

还有，这个程序需要open mpi

一旦涉及并行，估计都是高性能的了，还是不要在windows下浪费时间了