EXTRA_DIST = README Makefile.msvc.in merge-models.pl
EXTRA_DIRS = doc example sdk perl python ruby java swig
bin_PROGRAMS = crf_learn crf_test

AUTOMAKE_OPTIONS = no-dependencies
lib_LTLIBRARIES = libcrfpp.la
libcrfpp_la_SOURCES = crfpp.h thread.h libcrfpp.cpp lbfgs.cpp scoped_ptr.h param.cpp param.h encoder.cpp feature.cpp stream_wrapper.h ¥
                      feature_cache.cpp feature_index.cpp node.cpp path.cpp tagger.cpp ¥
      common.h darts.h encoder.h feature_cache.h feature_index.h ¥
                      freelist.h lbfgs.h mmap.h node.h path.h tagger.h timer.h
include_HEADERS = crfpp.h

dist-hook:
for subdir in $(EXTRA_DIRS); do ¥
  cp -rp $$subdir $(distdir); ¥
  rm -f $(distdir)/$$subdir/*‾; ¥
  rm -f $(distdir)/$$subdir/*.{bak,orig}; ¥
  rm -rf $(distdir)/$$subdir/CVS; ¥
  rm -rf $(distdir)/$$subdir/.svn; ¥
  rm -rf $(distdir)/.svn; ¥
  rm -rf $(distdir)/*/.svn; ¥
  rm -rf $(distdir)/*/*/.svn; ¥
  rm -rf $(distdir)/$$subdir/*/CVS; ¥
  rm -rf $(distdir)/$$subdir/*/.svn; ¥
  find $(distdir) -name .svn  | xargs rm -fr; ¥
done

win:
(cd src; rm -f *.exe *.obj *.dll)
# (cd src; wcmd /c make.bat)

win-dist:
rm -f @PACKAGE@-@VERSION@.zip
mkdir -p @PACKAGE@-@VERSION@/doc
mkdir -p @PACKAGE@-@VERSION@/example
mkdir -p @PACKAGE@-@VERSION@/sdk
cp -f crf_learn.exe @PACKAGE@-@VERSION@
cp -f crf_test.exe @PACKAGE@-@VERSION@
cp -f libcrfpp.dll @PACKAGE@-@VERSION@
cp -f libcrfpp.lib @PACKAGE@-@VERSION@/sdk
cp -f crfpp.h @PACKAGE@-@VERSION@/sdk
# cp -f sdk/model @PACKAGE@-@VERSION@/sdk
cp -f sdk/example.cpp @PACKAGE@-@VERSION@/sdk
cp -fr doc/*.html doc/*.css doc/doxygen @PACKAGE@-@VERSION@/doc
cp -f README COPYING AUTHORS LGPL BSD @PACKAGE@-@VERSION@
cp -fr example/* @PACKAGE@-@VERSION@/example
find @PACKAGE@-@VERSION@ -name CVS | xargs rm -rf
find @PACKAGE@-@VERSION@ -name .svn | xargs rm -rf
zip -r @PACKAGE@-@VERSION@.zip @PACKAGE@-@VERSION@
rm -fr @PACKAGE@-@VERSION@

crf_learn_SOURCES = crf_learn.cpp 
crf_learn_LDADD = libcrfpp.la

crf_test_SOURCES = crf_test.cpp 
crf_test_LDADD = libcrfpp.la 

dist-all-package:
(test -f Makefile) && $(MAKE) distclean
./configure
$(MAKE) dist
$(MAKE) clean
$(MAKE) script-clean
$(MAKE) script-dist
$(MAKE) win
$(MAKE) win-dist

script-dist:
for subdir in perl ruby python java; do ¥
  rm -fr CRF++-$${subdir}-@VERSION@; ¥
  mkdir CRF++-$${subdir}-@VERSION@; ¥
  cp -r $${subdir}/* CRF++-$${subdir}-@VERSION@; ¥
  cp -r doc/bindings.html  CRF++-$${subdir}-@VERSION@; ¥
  find ./CRF++-$${subdir}-@VERSION@ -type d -name CVS | xargs rm -fr; ¥
  rm -f CRF++-$${subdir}-@VERSION@/*‾; ¥
  tar zcfv CRF++-$${subdir}-@VERSION@.tar.gz CRF++-$${subdir}-@VERSION@; ¥
  rm -fr CRF++-$${subdir}-@VERSION@; ¥
done

script-clean:
(cd perl; $(MAKE) clean; rm -f Makefile.old Makefile)
(cd ruby; $(MAKE) clean; rm -f Makefile *.log)
(cd python; python setup.py clean --all)
(cd java; $(MAKE) clean;)

export-package:
./upload.pl -p crfpp -n crfpp        -r @VERSION@ -f CRF++-@VERSION@.tar.gz
./upload.pl -p crfpp -n crfpp-win32  -r @VERSION@ -f CRF++-@VERSION@.zip
scp doc/*.html sf:public_html/crfpp/
scp doc/*.css sf:public_html/crfpp/

建议你google一下Makefile，你这样问，多半不会有人给你详细注释的。
你需要写清楚需要问什么，你会什么，而不是拿出几十分让人给个详细注释！