[root@localhost snort]# snort -c /etc/snort/snort.conf 
Running in IDS mode

        --== Initializing Snort ==--
Initializing Output Plugins!
Initializing Preprocessors!
Initializing Plug-ins!
Parsing Rules file "/etc/snort/snort.conf"
PortVar 'HTTP_PORTS' defined :  [ 80:81 311 591 593 901 1220 1414 1830 2301 2381 2809 3128 3702 4343 5250 7001 7145 7510 7777 7779 8000 8008 8014 8028 8080 8088 8118 8123 8180:8181 8243 8280 8800 8888 8899 9080 9090:9091 9443 9999 11371 55555 ]
PortVar 'SHELLCODE_PORTS' defined :  [ 0:79 81:65535 ]
PortVar 'ORACLE_PORTS' defined :  [ 1024:65535 ]
PortVar 'SSH_PORTS' defined :  [ 22 ]
PortVar 'FTP_PORTS' defined :  [ 21 2100 3535 ]
PortVar 'SIP_PORTS' defined :  [ 5060:5061 5600 ]
PortVar 'FILE_DATA_PORTS' defined :  [ 80:81 110 143 311 591 593 901 1220 1414 1830 2301 2381 2809 3128 3702 4343 5250 7001 7145 7510 7777 7779 8000 8008 8014 8028 8080 8088 8118 8123 8180:8181 8243 8280 8800 8888 8899 9080 9090:9091 9443 9999 11371 55555 ]
Detection:
   Search-Method = AC-Full-Q
    Split Any/Any group = enabled
    Search-Method-Optimizations = enabled
    Maximum pattern length = 20
Tagged Packet Limit: 256
Loading dynamic engine /usr/local/lib/snort_dynamicengine/libsf_engine.so... done
Loading all dynamic detection libs from /usr/local/lib/snort_dynamicrules...
  Loading dynamic detection library /usr/local/lib/snort_dynamicrules/web-client.so... done
  Loading dynamic detection library /usr/local/lib/snort_dynamicrules/icmp.so... done
  Loading dynamic detection library /usr/local/lib/snort_dynamicrules/netbios.so... done
  Loading dynamic detection library /usr/local/lib/snort_dynamicrules/snmp.so... done
  Loading dynamic detection library /usr/local/lib/snort_dynamicrules/multimedia.so... done
  Loading dynamic detection library /usr/local/lib/snort_dynamicrules/dos.so... done
  Loading dynamic detection library /usr/local/lib/snort_dynamicrules/imap.so... done
  Loading dynamic detection library /usr/local/lib/snort_dynamicrules/specific-threats.so... done
  Loading dynamic detection library /usr/local/lib/snort_dynamicrules/exploit.so... done
  Loading dynamic detection library /usr/local/lib/snort_dynamicrules/web-iis.so... done
  Loading dynamic detection library /usr/local/lib/snort_dynamicrules/nntp.so... done
  Loading dynamic detection library /usr/local/lib/snort_dynamicrules/bad-traffic.so... done
  Loading dynamic detection library /usr/local/lib/snort_dynamicrules/web-activex.so... done
  Loading dynamic detection library /usr/local/lib/snort_dynamicrules/smtp.so... done
  Loading dynamic detection library /usr/local/lib/snort_dynamicrules/p2p.so... done
  Loading dynamic detection library /usr/local/lib/snort_dynamicrules/web-misc.so... done
  Loading dynamic detection library /usr/local/lib/snort_dynamicrules/chat.so... done
  Loading dynamic detection library /usr/local/lib/snort_dynamicrules/misc.so... done
  Finished Loading all dynamic detection libs from /usr/local/lib/snort_dynamicrules
Loading all dynamic preprocessor libs from /usr/local/lib/snort_dynamicpreprocessor/...
  Loading dynamic preprocessor library /usr/local/lib/snort_dynamicpreprocessor//libsf_imap_preproc.so... done
  Loading dynamic preprocessor library /usr/local/lib/snort_dynamicpreprocessor//libsf_ftptelnet_preproc.so... done
  Loading dynamic preprocessor library /usr/local/lib/snort_dynamicpreprocessor//libsf_sdf_preproc.so... done
  Loading dynamic preprocessor library /usr/local/lib/snort_dynamicpreprocessor//libsf_dce2_preproc.so... done
  Loading dynamic preprocessor library /usr/local/lib/snort_dynamicpreprocessor//libsf_reputation_preproc.so... done
  Loading dynamic preprocessor library /usr/local/lib/snort_dynamicpreprocessor//libsf_dns_preproc.so... done
  Loading dynamic preprocessor library /usr/local/lib/snort_dynamicpreprocessor//libsf_gtp_preproc.so... done
  Loading dynamic preprocessor library /usr/local/lib/snort_dynamicpreprocessor//libsf_modbus_preproc.so... done
  Loading dynamic preprocessor library /usr/local/lib/snort_dynamicpreprocessor//libsf_ssl_preproc.so... done
  Loading dynamic preprocessor library /usr/local/lib/snort_dynamicpreprocessor//libsf_pop_preproc.so... done
  Loading dynamic preprocessor library /usr/local/lib/snort_dynamicpreprocessor//libsf_ssh_preproc.so... done
  Loading dynamic preprocessor library /usr/local/lib/snort_dynamicpreprocessor//libsf_smtp_preproc.so... done
  Loading dynamic preprocessor library /usr/local/lib/snort_dynamicpreprocessor//libsf_sip_preproc.so... done
  Loading dynamic preprocessor library /usr/local/lib/snort_dynamicpreprocessor//libsf_dnp3_preproc.so... done
  Finished Loading all dynamic preprocessor libs from /usr/local/lib/snort_dynamicpreprocessor/
Log directory = /var/log/snort
!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
!! WARNING: The database output plugins are considered deprecated as
!!          of Snort 2.9.2 and will be removed in Snort 2.9.3.
!!          The recommended approach to logging is to use unified2 with
!!          barnyard2 or similar.
!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
database: must enter database name in configuration file


USAGE: database plugin

output database: [log | alert], [type of database], [parameter list]

[log | alert] selects whether the plugin will use the alert or
log facility.

For the first argument, you must supply the type of database.
The possible values are mysql, postgresql, odbc, oracle and
mssql 
The parameter list consists of key value pairs. The proper
format is a list of key=value pairs each separated a space.

The only parameter that is absolutely necessary is "dbname".
All other parameters are optional but may be necessary
depending on how you have configured your RDBMS.

dbname - the name of the database you are connecting to

host - the host the RDBMS is on

port - the port number the RDBMS is listening on

user - connect to the database as this user

password - the password for given user

sensor_name - specify your own name for this snort sensor. If you
        do not specify a name one will be generated automatically

encoding - specify a data encoding type (hex, base64, or ascii)

detail - specify a detail level (full or fast)

ignore_bpf - specify if you want to ignore the BPF part for a sensor

              definition (yes or no, no is default)

FOR EXAMPLE:
The configuration I am currently using is MySQL with the database
name of "snort". The user "snortusr@localhost" has INSERT and SELECT
privileges on the "snort" database and does not require a password.
The following line enables snort to log to this database.

output database: log, mysql, dbname=snort user=snortusr host=localhost


ERROR: 
Fatal Error, Quitting..

看上去好像你的MYSQL没有设置