请问在哪里进行设置呢?

u-boot中可以设置
rootfstype=jffs2 ro

这里仅仅是设置文件系统只读属性是么?

其他分区要在哪里设置呢?

首先我要知道你的linux jffes分区是如何实现的
常见的有2种
1、在内核启动参数中指定，类似mtdparts=phys:60m(filesystem),2m(kernel),1m(dtb),512k(env),512k(uboot)
2、在源代码中使用
static struct mtd_partition flash_parts[] = {
    {
        .name        = "u-boot",
        .offset        = 0x00000000,
        .size        = 0x00020000,           /* 128 KiB */
        .mask_flags    = MTD_WRITEABLE,
    },
    {
        .name        = "root",
        .offset        = 0x00020000,
        .size        = 0x007d0000,
    },
    {
        .name        = "env",
        .offset        = 0x007f0000,
        .size        = 0x00010000,
        .mask_flags    = MTD_WRITEABLE,
    },
};
这样的形式 

不知你是哪一种