文件是shell可执行脚本。
要求读入的数据符合shell解释规则。
比如：
aaa 
bbb
那么读入的行应该是 aaa bbb

你自己的解释已经定义好了程序的逻辑。实现起来不难，像perl这样的脚本语言可以按行读，很容易处理你的要求。
如果是C语言，简单的办法是一次把文件读到内存，用几个指针就可以处理了。大致的代码如下(注意程序并未调试，可能有错误)：
char* buffer;
int filelen;
char* buffer_end = buffer + filelen;
buffer = (char*)malloc(filelen);
/* read file data to buffer*/

char* line_start;
char* line_end;
char line_buffer[1024]; /* maximum line length is 1024 */

line_end = line_start;

while(line_end = buffer_end ) break;
  if (line_end 之前最后字符是'') {
    strncpy(line_buffer + line_offset, line_start, line_end - line_start);
    line_offset += line_end - line_start;  // 此处判断是否超过line_buffer大小
  }else {
    处理line_buffer并清空
    strncpy(line_buffer + line_offset, line_start, line_end - line_start);
  }
}