我在Linux上安装了J2sdk,然后在网上找到一份资料设置Java的运行环境,我是这样设置的:
更改/etc/profile来实现
export JAVA_HOME=/usr/java/j2sdk1.4.2_06
export CLASSPATH=.:$JAVA_HOME/lib/dt.jar:$JAVA_HOME/lib/tools.jar
export PATH=$PATH:$JAVA_HOME/bin 

但是据说这样设置对系统的安全性有影响,文章中建议修改.bashrc文件来设置Java的运行环境:
[root@LinuxServer rpm]#vi .bashrc
set JAVA_HOME=/usr/java/j2sdk1.4.2_06
export JAVA_HOME
set PATH=$PATH:$JAVA_HOME/bin
export PATH
set CLASSPATH=.:$JAVA_HOME/lib/dt.jar:$JAVA_HOME/lib/tools.jar
export CLASSPATH 

不过,我没有找到这个文件,请高手指定一下.

.bashrc是在每个用户HOME目录下的
vi ~/.bashrc
好像就可以了。

不过，这个用户得是你启动Java虚拟机的那个用户。
不然，设置不会起作用。

/etc/profile是针对所有用户的。

对安全有影响？我没听说过
一般都是

vim /etc/profile来实现

export JAVA_HOME=/usr/java/j2sdk1.4.2_06
export CLASSPATH=$JAVA_HOME/lib:$JAVA_HOME/jre/lib:.
export PATH=$PATH:$JAVA_HOME/bin

同意warabi(厥)，
用任意的编辑器编辑，再保存到你的HOME目录里就好了。

.bashrc是bash的配置文件，每打开一个新的shell这个文件就会被读一次，
用来设定一些环境变量，和对bash的设置。
相应的，.tcshrc是tcsh的配置文件。这些文件就是一个相应的shellscript.