我公司新建的网站是提供相册服务的，每个注册会员会有自己的一个文件夹，上传的所有图片均存储在该文件夹下。

如：我的会员帐号是test1，则会有一个文件夹：
usr/local/apache/htdocs/alumni/test1/

现在会员有四万多人，也就有了四万多个文件夹，除开程序及数据库等效率，发现文件夹和文件的速度越来越慢，包括在服务器端打开“alumni”文件夹后显示文件夹列表也相当慢，请问有什么办法提高文件夹物理存储速度吗？

或许你可以试试reiserfs 文件系统

ReiserFS基于快速平衡树(balanced tree)搜索，平衡树在性能上非常卓越，这是一种非常高效的算法。ReiserFS搜索大量文件时，搜索速度要比ext2快得多。
参考:
http://www.linuxforum.net/docnew/showthreaded.php?Cat=&Board=sys&Number=619&page=0&view=collapsed&sb=5&o=all&fpart=

reiserfs不错
另外,需要自己对文件进行包裹, 例如把1000个文件放在一个文件中存储, 用的时候先读文件头,确认文件的位置,然后再根据长度和偏移量来读取返回.也就是自己在系统的FS上再实现一个超简单的FS,

用raid0可以提高物理存储速度

或者可以使用负载均衡的集群，像openmosix

或者采用多层结构。

另外, 一个目录下最好不要超过300个文件,目录也属于文件

还有就是用系统的文件索引功能提高文件的查询速度.